R이란 무엇인가?
R은 1990년도 중반에 Ross Ihaka와 Robert Gentleman에 의하여 처음 개발이 되었는데, 두 사람 이름의 첫 글자가 모두 R로 시작하기 때문에 이들이 개발한 언어를 R이라 불렀다고 한다. 1997년 이후에는 R Development Core Team이 주도적으로 R 프로젝트를 조직하고 이끌어 왔다.R 프로그램의 설치
– R프로그램은 http://www.r-project.org 에서 무료로 다운로드할 수 있다.① 웹 브라우저의 주소창에서 http://cran.r-project.org 를 입력 혹은 R 홈페이지 좌측 메뉴에서 Download 섹션의 “CRAN” 을 클릭한다.
② R 홈페이지에서 CRAN을 클릭하여 이동하면 다음과 같이 다운로드할 위치를 선택한다.
– 지리적으로 가까운 곳을 선택하는 것이 좋다.
– 우리나라의 경우 “Korea” 로 되어 있는 곳을 찾아가면 된다.
③ R을 실행할 수 있는 운영체제는 Linux, MacOS X, Windows로 PC 운영체제를 거의 다 지원한다. 여기서는 Windows를 기준으로 설명 하겠다.
– “Download R for Windows” 를 클릭하여 이동한다.
④ 화면을 보면 “base”, “contrib” 그리고 “Rtools” 중에 선택할 수 있다. 각각은 다음과 같은 파일들을 제공해 준다.
– base : R의 설치 파일을 다운로드 받는다. R을 설치하고자 하는 경우 이곳을 통해 설치 파일을 다운로드 한다.
– contrib : R 자체에도 많은 기능이 있지만, 사용자들이 사용하면서 만든 추가적인 package 들을 다운로드할 수 있다.
– Rtools : R에서 사용할 package 들을 제작하고자 할 때 사용되는 도구들을 다운로드 할 수 있다.
– 설치를 위해 base를 클릭한다.
⑤ R을 실제로 다운로드 받는 페이지로 간단한 도움말과 함께 다운로드 받기 위한 링크를 제공한다.
– 상단의 “Download R x.xx.x for Windows”를 클릭하면 바로 다운로드를 받을 수 있다.
– 클릭하여 파일을 다운로드 받은 후 실행하면 된다.
R프로그램의 구성
R은 기본적으로 세 개의 창(R Consloe, R Editor, R Graphics)으로 이루어져 있으며 이후 사용자의 편의를 위하여 추가로 Data Editor창을 부를 수 있다.
① R Console : R 명령문을 입력하고 실행시키게 된다.
② R Editor : R 명령문 작성과 수정할 수 있다.
③ R Graphics : 사용자가 만든 그래프가 그려져 출력된다.
④ Data Editor : 사용자가 데이터를 수정할 수 있다. 주로 분석에 사용되는 데이터를 확인하기 위해 사용되어진다. (많이 사용되지 않는다.)
R 패키지 설치 및 이용
R을 사용해서 통계분석을 수행할 때 유용한 R 패키지(Packages)를 설치하면 많은 통계분석을 쉽게 실시할 수 있다.예를 들어 두 그룹간의 평균차이를 검정하는 t-test의 경우 R의 기본 연산명령어를 이용하여 검정을 할 수 있지만 간단한 함수들로 구현된 복잡한 R 명령어들을 이용하는 것 보다 패키지를 이용하면 보다 간단하게 통계적 계산 및 검정을 할 수 있다.
t-test의 경우 R 프로그램에 기본적으로 설치되어있는 “stats”라는 패키지에서 t.test(…) 이라는 함수를 이용할 경우 쉽게 검정결과를 볼 수 있다.
따라서 사용자가 통계분석의 목적에 맞는 R 패키지를 설치하는 것은 R 사용자에게 중요한 일이다.
연구자가 R에서 구조방정식(Structural Equation Models)을 수행하기 위해 패키지를 설치하는 방법은 세 가지 방법을 사용할 수 있다.
1) 웹사이트를 통한 패키지 설치
사용자가 직접 CRAN(Comprehensive R Archive Network: http://cran.r-project.org) 웹사이트를 방문해서 좌측 프레임 [Software] 메뉴의 “Packages“ 링크를 클릭하면 다양한 패키지 목록이 나타난다.
- Table of available packages, sorted by date of publication : 패키지들이 등록된 날짜를 기준으로 정렬되어있다.- Table of available packages, sorted by name : 패키지들이 이름순으로 정렬되어있다.
- 위쪽 프레임의 패키지 이름과 간단한 사용 목적을 읽어보면서 필요한 패키지를 찾은 후 이름을 클릭한다. Structural Equation Models 라는 설명이 있는 sem 패키지를 클릭한다.
- 패키지의 기능에 대한 요약설명을 읽어보고 찾고 있는 기능이 포함되어있는지를 판단한다. 만약 이미 설치한 패키지라면 버전에서 업데이트 정보를 확인할 수 있다. 사용자가 필요로 하는 패키지라 판단이 되면 [Windows binaries] 옆의 압축파일을 다운받는다.
 - 패키지를 다운로드 받은 후에 R Console의 [패키지들] 메뉴에서 [로컬에 있는 zip 파일들로부터 패키지(들) 설치…]을 클릭하여 파일을 선택하면 패키지가 설치된다. 2) R Console에서 직접 설치 패키지를 설치하는 또 다른 방법은 웹사이트에서 패키지의 필요 유무만 확인하고 R Console의 [패키지들] 메뉴에서 [패키지(를) 설치하기…]를 클릭하는 방법이다. 이 방법은 CRAN mirror 사이트 중 한 곳을 지정한 후 패키지 목록에서 이름을 선택하여 설치한다. |
② CRAN mirror 사이트 선택
③ 패키지 목록 중 sem 클릭 후 확인
④ 설치 완료 화면
[패키지들] 메뉴에서 [CRAN 미러 설정…]을 클릭하여 패키지를 설치할 때 접속할 곳을 미리 지정해 놓으면 다음에 mirror 사이트를 다시 지정할 필요가 없다.
- 일반적인 통계계산 및 분석에 사용할 수 있는 패키지는 CRAN에서 설치가 가능하지만 예를 들어 Bioinformatics 영역의 유전자 데이터 분석에 필요한 패키지를 설치하고자 한다면 [패키지들] 메뉴에서 [저장소 선택…]을 클릭한 후 저장소(Repositories)선택 팝업 창에서 BioC 관련 저장소들을 선택한 후 [OK]버튼을 눌러주면 된다.
3) 명령어를 이용하여 직접 설치
패키지를 설치하는 마지막 방법은 R Console에서 install.packages(“패키지명”)을 이용하여 패키지를 설치하는 방법이다.
위에서 언급한 “sem” 패키지를 설치하기 위해 R Console에 install.packages(“sem”)을 입력한 후 엔터를 치고 mirror 사이트를 선택하면 R이 직접 다운로드하고 설치한다.
4) 패키지의 이용
R은 패키지를 설치하는 것만으로 그 패키지들에 포함되어있는 함수들을 바로 사용할 수 없다. 설치한 패키지에 포함된 함수를 사용하기 위해서는 R Console에서 library(패키지이름) 또는 require(패키지이름)을 입력하고 엔터키를 누르면 사용할 수 있게 된다.
※ R은 패키지를 한번 설치하면 프로그램을 삭제하기 전까지 사용할 수 있다. 하지만 매번 R을 사용할 때마다 library 또는 require를 이용하여 패키지를 불러들여야 한다.
단, Tinn-R, R-studio 등을 이용할 경우 이전에 설치한 패키지들을 자동으로 불러주는 기능이 있다. 이 프로그램들은 여기서 설명하지 않는다.
>library(sem)
or
>require(sem)
R의 도움말 사용
– 해당 함수 또는 패키지의 기능을 알 수 없는 경우 도움말을 이용하여 알 수 있다.
- 하나의 방법으로는‘?’를 사용하는 것이다. 예를 들어 mean 함수를 사용하는 방법을 알려면 R Console에 ?mean 이라고 명령어를 입력한다.
※ 주의할 점은 R에서 기본으로 제공되는 함수가 아닐 경우 패키지가 설치되어 있고 R에 불러온 상태에서 도움말을 볼 수 있다.
- Help 메뉴의 활용R 의 메뉴 중에서 Help를 선택하고 여기서 Html Help를 사용한다. 여기에 들어가서 Reference 중 Search Engine & Keywords을 택한다. 여기서 도움을 얻고자 하는 내용을 적는다.
물론 이 경우, 관련 내용에 대한 적절한 영어 단어를 생각하여 이를 적어야 한다.
예를 들어 분산분석 (analysis of variance)에 대한 명령들을 알아보고 싶다면 variance 또는 ANOVA 라는 단어를 입력한다.
이 결과 여러 가지 모형에 대한 R 명령어가 나타날 것이다.
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